在临床上，随着抑酸剂的广泛应用和根除Hp疗法的积极开展，胃及十二指肠溃疡已不再难以愈合，绝大多数患者都能在规范治疗下得以治愈。然而，受到以下疾病的影响，仍有少数患者表现为病情反复，溃疡难以完全愈合。
高血压血压升高可造成胃肠道营养血管硬化，使得胃肠道黏膜缺血，削弱机体的修复能力。因此，合并高血压的胃及十二指肠溃疡患者往往疗效较差，愈合缓慢，疗程较长，容易反复。
肝脏疾病慢性肝病、肝硬化都可因肝功能减退而使得肝脏灭活胃泌素、组织胺等活性物质的能力下降，刺激胃酸大量分泌，加重黏膜受损程度。另外，肝硬化所致门脉高压和白蛋白的减少，也会延迟溃疡的愈合速度。
慢性阻塞性肺病缺氧和二氧化碳潴留是慢性阻塞性肺病最重要的病理变化，其中，二氧化碳潴留可引起胃酸大量分泌，缺氧可干扰溃疡修复及愈合。所以，合并慢性阻塞性肺病的胃及十二指肠溃疡常常呈现难治状态。
糖尿病糖尿病也可造成溃疡难治，其机理包括：①引起胃肠道营养血管硬化，容易造成胃肠壁供血不足，影响溃疡愈合；②周围神经损害促使胃泌素异常分泌，导致胃酸分泌增多。
慢性胰腺炎患慢性胰腺炎时因抑制胃酸分泌的局部激素减少，因而常常伴有大量胃酸分泌，导致溃疡难以愈合。
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